La vita sulla Grande Barriera Corallina è piena di pericoli quando sei un piccolo pesce pagliaccio e sei la fonte delle continue paure e ansie del tuo papà. Protagonisti di questa incredibile storia sono proprio due pesci, Nemo e il suo papà Marlin, deciso a fare di tutto pur di proteggerlo. Quando per Nemo arriva il momento di lasciare il suo rifugio sicuro nell`anemone di mare per il primo giorno di scuola, Marlin lo accompagna preoccupato e si lascia prendere dall`angoscia ad ogni suo movimento. Quando Nemo sfida il padre e nuota oltre l`imponente "baratro" della barriera per curiosare intorno ad una barca, viene improvvisamente catturato da un sub mentre Marlin assiste impotente. Il senso di sconforto di Marlin si trasforma in una reazione disperata mentre nuota via sconsolato in cerca del figlio. La sua prima disavventura è lo scontro con Dory, un piacevole pesce chirurgo blu che gli offre il suo aiuto. L`unico problema è che Dory soffre di gravi vuoti della memoria a breve termine e dimentica le cose appena accadute. Insieme, questa strana coppia acquatica, intraprende una missione impossibile... la ricerca del figlio.